Suivi moléculaire des microorganismes du lisier de porcs au travers des filières de traitement

/ Les impacts environnementaux des élevages intensifs et des épandages ont conduit à la mise en place de procédés de traitement de lisier, visant à diminuer les quantités d'azote et de phosphore épandues. L'impact de ces traitements sur la communauté bactérienne de lisier a été observé par amplification partielle des ADNr 16S et CE-SSCP. Il est bien visible lors des traitements biologiques (aération, lagunage) mais indétectable lors des traitements physiques (centrifugation, décantation). De plus, différentes méthodes d'extraction d'ADN ont été comparées sur les matrices utilisées (lisier, compost, sol). Le kit Powersoil de MoBio semble plus efficace, tant au niveau de la qualité de l'ADN extrait, qu'au niveau de la richesse de la diversité bactérienne extraite.