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Comparaison de la technique de dHPLC (denaturing High Performance Liquid Chromatography) avec une méthode de référence la SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) en vue de l'étude d'écosystèmes microbiens complexes

Julien, A.S. - 2015
/ Afin de comprendre le fonctionnement des flores microbiennes complexes, différents outils prospectifs se sont développés. Historiquement, les méthodes de mise en culture étaient les premières à caractériser ces niches écologiques complexes. Aujourd'hui différents outils basés sur l'ADN codant pour l'ARN 16S se sont développés et notamment des techniques qui permettent de visualiser l'écosystème microbien sans faire appel aux techniques culturales. Ces outils dits de « fingerprinting » se sont développés parallèlement sans qu'aucune comparaison entre ces techniques ne soit réalisée. Dans ce rapport, une étude comparative de méthodes est proposée, plus exactement la technique de la SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) et la dHPLC (denaturing High Performance Liquid Chromatography).

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