Ancrage du génome du piment aux génomes de la tomate et de la pomme de terre et au génome d'Arabidopsis thaliana

Tous les organismes vivants actuels sont supposés avoir évolué à partir d’ancêtres communs et sont comparables sur la base de régions chromosomiques communes. La génomique comparative consiste à utiliser des espèces modèles (Arabidopsis thaliana, tomate…) pour décrire le génome plus complexe d’espèces phylogénétiquement proches. Des cartes génétiques du piment et de la pomme de terre ont été réalisées en partie avec des sondes moléculaires venant de la tomate. Dans ce contexte, trois cartes génétiques intraspécifiques du piment ont été développées au laboratoire dans le but de cartographier sur le génome et de caractériser des locus d’intérêt agronomique, notamment le locus Phy-P5 impliqué dans la résistance quantitative (QTL) au pathogène mycélien Phytophthora capsici. Dans le cadre de notre étude, un total de 191 marqueurs moléculaires a été localisé sur la carte F5YC du piment plus particulièrement dans la région de Phy-P5 dont la position a été précisée. Les trois cartes génétiques du piment ont été alignées entre elles et ancrées aux cartes génétiques de la tomate, de la pomme de terre et d’Arabidopsis thaliana avec des marqueurs communs. Les résultats obtenus confirment que nous pouvons bénéficier d’informations de génomique sur les espèces modèles notamment pour caractériser des locus d’intérêt. L’utilisation de nouvelles méthodes de génotypage à haut débit permettra de développer de nouveaux marqueurs ancres sur l’ensemble du génome, notamment dans le but de réaliser le clonage positionnel de Phy-P5, et de tester l’hypothèse d’une origine ancestrale de ce locus.