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Lettre "Biodiversité aquatique" - Janvier 2026

Chers lecteurs et chères lectrices,

L’équipe de la lettre BiodivAqua vous présente ses meilleurs vœux pour cette année 2026.

Avant de repartir vers de nouvelles aventures informationnelles, nous vous proposons dans notre « A la Une », de nous pencher sur un passé proche.

Novembre 2025, 12ème édition des Rencontres Migrateurs de Loire. Le sujet : « Des écailles aux données ; les nouvelles frontières de l’échantillonnage ».

Notre « A la Une » vous ouvre les portes de ces rencontres en vous proposant les résumés des présentations.

Un article sur le projet INDINAT visant à produire des indicateurs sur les poissons migrateurs, un guide méthodologique sur l’ADN environnemental et un article sur la restitution du projet COLAGANG sur l’anguille européenne complètent cette immersion dans l’univers des migrateurs et des données collectées pour les étudier.

Bonne lecture

L’équipe BiodivAqua
 



A la une

image Rencontres Migrateurs de Loire 2025 - Logrami (présentations)
[Diaporama] - Rencontres Migrateurs de Loire 2025 - Logrami (présentations)

Cette édition a été l’occasion de s’intéresser aux différents traits de vie des poissons à travers leur génétique et aux différents protocoles pour définir l’état des populations dans divers milieux.

www.logrami.fr
image Suivre l’Anguille européenne pour mieux la protéger : restitution du projet COLAGANG
[Article scientifique] - Suivre l’Anguille européenne pour mieux la protéger : restitution du projet COLAGANG

L’Anguille européenne (Anguilla anguilla) est un poisson migrateur aux déplacements extraordinaires : elle parcourt des milliers de kilomètres, entre la mer des Sargasses (centre-ouest de l’océan Atlantique) – son lieu de reproduction – et les eaux continentales européennes et nord-africaines, sa zone de croissance.

tourduvalat.org
image Publication des premiers indicateurs nationaux sur les poissons migrateurs – projet INDINAT - Logrami
[Actualité] - Publication des premiers indicateurs nationaux sur les poissons migrateurs – projet INDINAT - Logrami

Dans le cadre du Plan National de Gestion des Poissons Migrateurs Amphihalins (PNMA), les Associations Migrateurs de France ont développé le projet INDINAT, dont l’objectif est de produire des indicateurs sur les poissons migrateurs à l’échelle nationale.

www.logrami.fr
image Guide d'utilisation de l'ADN environnemental
[Guide méthodologique] - Guide d'utilisation de l'ADN environnemental

Ce guide vise à fournir une synthèse des méthodes couramment utilisées en matière d’inventaire et de suivi de la biodiversité des fleuves et des rivières par utilisation de l’ADN environnemental (ADNe).

www.spygen.com

Evènement

image Hydrosystèmes et relations interspécifiques : regards croisés sur le castor et l'anguille (12 février, Nanterre)
[Evènement] - Hydrosystèmes et relations interspécifiques : regards croisés sur le castor et l'anguille (12 février, Nanterre)

À propos du castor… Une promesse d’avenir fondée sur l’écologie de la réconciliation

mosaiques.parisnanterre.fr
image Webconférence thématique : la biosurveillance acoustique pour le suivi écologique des cours d'eau
[Evènement] - Webconférence thématique : la biosurveillance acoustique pour le suivi écologique des cours d'eau

Cette manifestation sera l'occasion de dresser le bilan de la première phase (3 ans) du programme Sein'acoustic qui associe SUEZ et le SIAAP pour développer des indicateurs acoustiques afin de suivre en temps réel la qualité écologique du fleuve. Cette webconférence permettra également de rappeler l'intérêt de l'écoacoustique et ses applications notamment en eau douce.

inneauvation.fr

Connaissance des habitats et espèces

image Synthèse bibliographique - Enjeux de conservation de la macrobiodiversité des lacs de montagne français
[Note de synthèse] - Synthèse bibliographique - Enjeux de conservation de la macrobiodiversité des lacs de montagne français

Cet article propose une synthèse bibliographique pour une meilleure compréhension des enjeux de conservation de la macrobiodiversité des lacs de montagne en France. Il apporte des pistes de réflexions avec la présentation de retours d’expériences sur des mesures de gestion mises en place dans ces milieux.

sciencepress.mnhn.fr
image Un Martin-pêcheur d’Amérique découvert en Bretagne en décembre 2025 attire de nombreux observateurs
[Article de revue] - Un Martin-pêcheur d’Amérique découvert en Bretagne en décembre 2025 attire de nombreux observateurs

Un individu a été découvert le 11 décembre 2025 près de Glomel (Côtes-d'Armor), fournissant a priori la première donnée en France métropolitaine de cette espèce nord-américaine.

www.ornithomedia.com
image Le Campagnol amphibie : découverte d’un rongeur discret pour l’ABC des Sorgues du Comtat
[Actualité] - Le Campagnol amphibie : découverte d’un rongeur discret pour l’ABC des Sorgues du Comtat

La LPO PACA accompagne la Communauté d’Agglomération des Sorgues du Comtat dans son projet d’Atlas de la Biodiversité Communale (ABC) sur 5 communes : Sorgues, Bédarrides, Pernes-les-Fontaines, Althen-des-Paluds et Monteux.

www.lpo.fr
image Programme d’inventaire des macrophytes et des végétations associées du bassin de la Seine sur le territoire de la Normandie
[Actualité] - Programme d’inventaire des macrophytes et des végétations associées du bassin de la Seine sur le territoire de la Normandie

La flore et les végétations liées au monde strictement aquatique sont relativement méconnues. Les principales causes de méconnaissance sont liées à des difficultés d’identification, à la dispersion des données et au manque de données pour les bryophytes, algues, lichens et champignons.

www.cbn-normandie.fr
image Le retour de la loutre d’Europe
[Vidéo/Film] - Le retour de la loutre d’Europe

La loutre d’Europe, qui a quasi disparu dans les années 1970 à cause de la chasse et de la pollution, fait son retour dans une grande partie de la France. Mais quels sont les indices de sa présence ? Reportage sur le Lez, le fleuve qui traverse Montpellier, en partenariat avec Le Monde.

lejournal.cnrs.fr
image Castor d'Europe, le grand retour. Démographie, effets sur les milieux, cohabitation. Synthèse du colloque national des 12 et 13 décembre 2024
[Actes de conférence] - Castor d'Europe, le grand retour. Démographie, effets sur les milieux, cohabitation. Synthèse du colloque national des 12 et 13 décembre 2024

Ces deux journées très riches ont permis de faire le point sur la répartition et les dynamiques démographiques du Castor d'Europe, de partager les connaissances récentes sur son comportement, ses effets sur l’environnement et les services écosystémiques associés.

ofb.gouv.fr
image Il a été aperçu dans le Sorpt à Chasteaux, le castor est de retour en Corrèze
[Article de presse] - Il a été aperçu dans le Sorpt à Chasteaux, le castor est de retour en Corrèze

Près de 200 ans après avoir disparu des rivières de la Corrèze, le castor y revient. Sa présence a été détectée près du lac du Causse dans le Sorpt à Chasteaux. Les naturalistes cherchent maintenant à retracer le chemin qui l'y a amené.

www.francebleu.fr

Continuité écologique

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[Article de presse] - "Travailler sur les petits chevelus": soigner les petits cours d'eau pour faire de belles rivières

Depuis plus de trente ans, le Syndicat d'aménagement du bassin de Vienne gère et assure la surveillance des structures installées sur les cours d'eau de la Haute-Vienne. L'établissement public, financé par une centaine de communes, met en œuvre des actions destinées à améliorer ou préserver la biodiversité des milieux aquatiques.

france3-regions.franceinfo.fr
image La Durance, une rivière domptée au détriment du vivant
[Article de presse] - La Durance, une rivière domptée au détriment du vivant

Les eaux détournées de la Durance, véritable artère énergétique aménagée dès les années 1950 par un vaste réseau de barrages et centrales hydroélectriques, sont indispensables à la prospérité de la Provence. Mais ces aménagements et prélèvements ont des conséquences écologiques majeures sur la biodiversité.

www.liberation.fr
image Mercantour : quand des alevins sont héliportés pour préserver les lacs d’altitude
[Vidéo/Film] - Mercantour : quand des alevins sont héliportés pour préserver les lacs d’altitude

En France, dans le Massif du Mercantour, depuis plus de 30 ans, des milliers d’alevins sont transportés par hélicoptère chaque année pour être relâchés avec d’infinies précautions dans les lacs d’altitude... Une opération commando organisée par les pêcheurs des Alpes Maritimes afin de garantir le peuplement des rivières …

www.youtube.com
image Dans le Sud-Manche, un contrat à 20 millions d’euros pour améliorer la qualité de l’eau jusqu’en 2028
[Actualité] - Dans le Sud-Manche, un contrat à 20 millions d’euros pour améliorer la qualité de l’eau jusqu’en 2028

Mercredi 17 décembre 2025, la communauté d’agglomération Mont-Saint-Michel Normandie, le Sdeau50, le SMPGA ainsi que l’agence de l’eau Seine-Normandie ont signé un contrat qui engage le Sud-Manche pour six ans dans 147 actions pour restaurer les rivières, sécuriser l’alimentation en eau et protéger la baie du Mont-Saint-Michel.

www.ouest-france.fr
image Création d'embacles par bucheronnage semi fixes sur la Brévenne à Lozanne (69)
[Vidéo/Film] - Création d'embacles par bucheronnage semi fixes sur la Brévenne à Lozanne (69)

Gregory Chazal du Syribt présente la diversification avec des arbres abattus pour redynamiser la Brévenne à Lozanne (69)

www.youtube.com
image Polynésie : A Manihi, le Rahui a redonné vie au lagon
[Article de presse] - Polynésie : A Manihi, le Rahui a redonné vie au lagon

À Manihi, le Rahui, cette pratique ancestrale de préservation des ressources, a porté ses fruits. Instauré il y a 8 ans, il a transformé le visage du lagon. « Les poissons sont revenus. On voit des grosses pièces sur le récif et dans la passe”, constate avec plaisir un pêcheur de l’atoll. 

outremers360.com
image Une
[Article de presse] - Une "opération castor" menée en Haute-Vienne

Elle a été réalisée par le conservatoire d'espaces naturels de Nouvelle-Aquitaine sur les zones humides de Pressac, à Feytiat.

www.lepopulaire.fr
image Comment le crapaud le plus menacé de France pourrait être sauvé grâce à des mares
[Article de presse] - Comment le crapaud le plus menacé de France pourrait être sauvé grâce à des mares

Dans le nord-est de l'Alsace, un amphibien menacé d'extinction pourrait sauver sa peau grâce à la création de plusieurs mares réparties sur cinq communes. L'opération de la dernière chance a débuté par la création de la première mare, ce mardi 16 décembre 2025.

france3-regions.franceinfo.fr
image Redonner à la Bonne son espace de liberté
[Actualité] - Redonner à la Bonne son espace de liberté

Pendant près d'un siècle, la rivière la Bonne a été corsetée, creusée et endiguée dans la plaine de Valbonnais. Mais à vouloir trop la contraindre, c’est tout un écosystème qui s’est fragilisé : un lit qui s'enfonce, des forêts alluviales qui dépérissent et des poissons bloqués dans leur migration. Aujourd’hui, le SYMBHI rend à la Bonne son espace de liberté.

www.sauvonsleau.fr

Actions participatives

image Ce que révèle une vaste enquête citoyenne sur la qualité de l’eau en France
[Article de presse] - Ce que révèle une vaste enquête citoyenne sur la qualité de l’eau en France

En 2023, des milliers de citoyens ont pris part à un projet de recherche participative visant à cartographier la qualité de l’eau sur le territoire français. Une démarche qui en apprend beaucoup aux chercheurs et qui sensibilise les bénévoles.

theconversation.com
image Présentation de l'Aquathèque, Maison régionale de l'eau
[Actualité] - Présentation de l'Aquathèque, Maison régionale de l'eau

Cette médiathèque numérique en ligne propose des contenus fiables, vérifiés et objectifs sur l’eau et les milieux aquatiques.

www.maisonregionaledeleau.org
image Flow, jeu vidéo pédagogique
[Actualité] - Flow, jeu vidéo pédagogique

Le Syndicat Mixte Yonne Médian a travaillé avec l’école CRÉASUP Digital pour concevoir un jeu vidéo pédagogique visant à sensibiliser, de manière ludique, aux bonnes et mauvaises pratiques liées aux rivières. Dans ce jeu, vous accompagnez Crue’Zoé après une inondation. Votre mission : découvrir les bonnes pratiques et réaménager le bassin versant pour réduire le risque d’inondation sur le territoire.

jeu.yonnemedian.com
image Fréquence Grenouille - Fédération des conservatoires d'espaces naturels
[Evènement] - Fréquence Grenouille - Fédération des conservatoires d'espaces naturels

Fréquence Grenouille donne l’occasion de sensibiliser le public sur la nécessité de protéger les zones humides, ces milieux rares, qui ont subi de nombreuses atteintes et destructions.

reseau-cen.org
image Des millions d’amphibiens écrasés sur les routes chaque année : en Franche-Comté, serez-vous bénévoles pour les sauver ?
[Article de presse] - Des millions d’amphibiens écrasés sur les routes chaque année : en Franche-Comté, serez-vous bénévoles pour les sauver ?

Chaque printemps, des millions de crapauds, grenouilles, salamandres et autres amphibiens sont écrasés sur les routes alors qu'ils migrent vers leurs lieux de reproduction. Pour les sauver, la Ligue pour la protection des oiseaux a trouvé une solution. Mais, en Franche-Comté, elle a besoin de bénévoles pour l'appliquer.

france3-regions.franceinfo.fr
image Cap Biodiversité, une Nouvelle-Aquitaine engagée
[Publication] - Cap Biodiversité, une Nouvelle-Aquitaine engagée

La biodiversité est notre bien commun. Elle constitue le socle de notre santé, de notre alimentation, de notre économie et de notre qualité de vie. Pourtant, en Nouvelle-Aquitaine comme ailleurs, elle s’érode rapidement. 

www.biodiversite-nouvelle-aquitaine.fr

Etat des milieux

image Moule quagga protection des installations de pompage par ultrasons
[Article scientifique] - Moule quagga protection des installations de pompage par ultrasons

La moule quagga représente un risque majeur pour les prises d’eau et les infrastructures lacustres en Suisse. Un dispositif de protection a été testé durant plusieurs mois sur une conduite du site des Jeunes-Rives à Neuchâtel. Les premiers résultats confirment une forte réduction de la colonisation sans impact sur l’environnement.

www.aquaetgas.ch
image Quand les rivières se réchauffent : quel avenir pour les truites de la Soča ? – Tour du Valat
[Actualité] - Quand les rivières se réchauffent : quel avenir pour les truites de la Soča ? – Tour du Valat

Cette espèce a failli disparaître de la Soča en raison de son hybridation avec la truite commune Salmo trutta. La truite marbrée, une espèce sensible au réchauffement La truite marbrée (Salmo marmoratus) est une espèce endémique du bassin adriatique, présente uniquement dans certaines rivières de Slovénie et d’Italie. 

tourduvalat.org
image Dans la Loire, le temps de pêche de l’alose et de la lamproie réduit de moitié : « C’est un moindre mal »
[Article de presse] - Dans la Loire, le temps de pêche de l’alose et de la lamproie réduit de moitié : « C’est un moindre mal »

Les pêcheurs professionnels en eau douce de Loire-Atlantique pourront pêcher l’alose et la lamproie du jeudi 15 janvier au mardi 31 mars. Une période réduite afin de préserver la ressource, mais qui ampute le chiffre d’affaires de trente-quatre des soixante entreprises de pêche concernées par l’arrêté préfectoral.

www.ouest-france.fr
image Colloque Une seule santé - Jean Laroche (Université de Bretagne)
[Webinaire] - Colloque Une seule santé - Jean Laroche (Université de Bretagne)

Durant le colloque annuel d'Eau & Rivières de Bretagne sur le thème "Une seule santé, pas de futur sans nature", Jean Laroche, professeur émérite de l’université de Bretagne occidentale au Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin, nous a expliqué comment l’état de santé des poissons reflète l’état de santé des hydrosystèmes en prenant le cas des estuaires bretons.

www.youtube.com

Climat

image À cause du réchauffement climatique, la moitié des cigognes de Charente-Maritime ne migrent plus
[Article de presse] - À cause du réchauffement climatique, la moitié des cigognes de Charente-Maritime ne migrent plus

Le Sahel devient trop chaud, la façade atlantique est moins rude en hiver. Le phénomène migratoire se raréfie à tel point que la moitié des 650 couples de cigognes ne quittent pas la Charente-Maritime, tel est le constat du programme scientifique Cigognes de Saintonge.

www.francebleu.fr

Politique publique

image Les poissons d'eau douce sous-représentés dans la Convention sur les espèces migratrices (article en langue anglaise)
[Article scientifique] - Les poissons d'eau douce sous-représentés dans la Convention sur les espèces migratrices (article en langue anglaise)

Action is urgently needed to unlock the potential of the Convention on the Conservation of Migratory Species of Wild Animals (CMS) to advance the conservation of migratory freshwater fishes, according to a paper published today in Nature Reviews Biodiversity.

iucn.org
image Quantification de la protection globale des espèces de faune et de flore menacées en France, à l’échelle mondiale ainsi qu’à travers les territoires et les groupes taxonomiques (article en langue anglaise)
[Article scientifique] - Quantification de la protection globale des espèces de faune et de flore menacées en France, à l’échelle mondiale ainsi qu’à travers les territoires et les groupes taxonomiques (article en langue anglaise)

Dans un contexte de perte rapide de biodiversité, la protection des espèces menacées est devenue un enjeu crucial. En comparant les bases de données de référence sur les espèces de faune et de flore menacées et protégées en France, nous avons quantifié l'écart entre l'évaluation du niveau de menace et la législation de protection. Plus de la moitié des espèces menacées ne sont pas protégées. 

www.sciencedirect.com
image 76 plans nationaux d’actions en faveur des espèces menacées en vigueur en 2025
[Publication] - 76 plans nationaux d’actions en faveur des espèces menacées en vigueur en 2025

Outils stratégiques visant à assurer la conservation ou le rétablissement des espèces de faune et de flore sauvages, les plans nationaux d’actions (PNA) ont été instaurés en France pour la première fois en 1996. Au 1er octobre 2025, 76 PNA sont en vigueur couvrant plus de 470 espèces (hors PNA pollinisateurs).

www.statistiques.developpement-durable.gouv.fr
image De l’acquisition à la planification, les ABC en question
[Publication] - De l’acquisition à la planification, les ABC en question

Sur la base des résultats de l’évaluation des effets des ABC en Bretagne de 2010 à 2023, quatre mémentos et un recueil méthodologiques voient le jour à la suite d'un important travail d'élaboration collective, afin de faciliter la mise en œuvre des projets de territoires auxquels contribuent les ABC et les projets TVB.

www.trameverteetbleue.fr

Réglementation

image Liste rouge Poissons et écrevisses d’eau douce des Hauts-de-France
[Actualité] - Liste rouge Poissons et écrevisses d’eau douce des Hauts-de-France

C’est la première fois en Hauts-de-France que les poissons et les écrevisses d’eau douce se voient doter d’une liste rouge régionale. Cette liste a été labellisée par le comité français de l’UICN et validée par le Conseil scientifique régional du patrimoine naturel.

www.peche62.fr

Les inclassables

image Les applications d’identification de la nature : entre réduction du vivant et potentiel écologique. Analyse critique et diplomatique pour un design numérique centré vivant
[Article scientifique] - Les applications d’identification de la nature : entre réduction du vivant et potentiel écologique. Analyse critique et diplomatique pour un design numérique centré vivant

Les applications dites d’identification ou de (re)connexion avec la nature, telles qu’iNaturalist ou PlantNet, se présentent comme des outils de médiation entre humains et non-humains. Reposant sur des logiques participatives et mobilisant l’intelligence artificielle pour identifier les espèces, ces dispositifs reconduisent cependant un regard anthropocentré, naturaliste et instrumental sur le vivant. 

www.unilim.fr
image Dans les torrents, des insectes tissent de minuscules filets de pêche qui inspirent de nouveaux matériaux
[Article de presse] - Dans les torrents, des insectes tissent de minuscules filets de pêche qui inspirent de nouveaux matériaux

Au fond des torrents et des ruisseaux, de petites larves d’insecte construisent des filets pour attraper leur nourriture et font preuve d’une intelligence remarquable pour s’adapter au courant. Les organismes filtreurs sont de véritables nettoyeurs des rivières et des torrents, de petits ingénieurs qui améliorent la qualité des eaux. 

theconversation.com

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